是。
财政部国家税务总局财税字（94）074号文件规定：企业免征或退还营业税（包括立即退税，首次退税），但国务院，财政部另有规定的除外财政部和国家税务总局除具有特定目的的项目外，应将其纳入企业利润，并按规定征收企业所得税。因此，首先征收的增值税然后作为补贴收入退还的增值税应缴纳企业所得税。