通常的做法是，根据合伙企业股份转让当年的累计利润计算应缴所得税，然后从转让人应获得的利润或企业份额中扣除。
根据《财政部国家税务总局关于合伙企业合伙人所得税问题的通知》（财税[2008] 159号），合伙企业的每一合伙人均为纳税人。合伙人为自然人，并缴纳个人所得税；合作伙伴是法人和其他组织，并缴纳企业所得税。
对于合伙企业本身，它不缴纳企业所得税，而是缴纳个人所得税。根据独资企业的生产经营税缴纳。合伙人之间的法人企业，应当在取得合伙企业的收入后缴纳企业所得税。
合伙企业应将每个合伙人作为纳税人。合伙人为自然人，并缴纳个人所得税；合作伙伴是法人和其他组织，并缴纳企业所得税。
扩展数据
有限合伙制由普通合伙人和有限合伙人组成。普通合伙人对合伙企业的债务承担无限连带责任，有限合伙人在其认缴的资本额范围内对合伙企业的债务承担责任。
有限合伙企业实现了企业管理权和出资权的分离，可以结合企业管理和资本方的优势，因此它们是外国私募基金的主要组织形式。
参考：百度百科全书