从“应税收入”中扣除而不是从“税额”中扣除。
如果（不考虑个人税的实际计算方法）：
的应税收入为990元，税率为10％。该人目前的应纳税额为99元。
现在，扣除500元：
（990-500）×10％= 49元
根据《一百税法》及相关规定，自今年1月1日起，扣缴义务人向居民个人支付工资收入时，应当按照累计扣缴法预扣个人所得税。累积扣缴法只是意味着您可以从年初开始扣除自年初以来单位的所有薪水收入，例如费用扣除（即“起点”），““三险一金”，特殊的额外扣除等，减少的余额将根据相应的预提税率表（与综合收入年度税率表相同）进行计算，以计算自开户以来应预缴的所有税款年份，然后减去上个月的预付款使用已缴税款，您可以计算本月应提前缴纳的税款。
在实际计算税额时，部门的税务人员将本月的收入和特殊抵减额输入税务机关提供的免费软件中，并可以直接计算应在本月提前支付的税额。采用这种预扣税法的原因主要是考虑到税改后的收入已计入综合收益，该税是每年计算的，并且税金越来越少地退还。如果按照税改前的方法预缴了税款年底将有很多薪资纳税人需要特殊的退税或退税。累积扣缴法将有效解决这一问题。对于大多数只有一个薪水的纳税人，在纳税年度结束时支付的预扣税基本上等于应纳税额。处理结算和结算的声明；同时，即使纳税人需要补足或退税，金额也相对较小，不会占用纳税人过多的资金。
《个人所得税法实施条例》规定：个人通过中国的社会组织和国家机关将收入捐赠给教育事业和其他社会公益事业，严重的自然灾害和贫困地区。应纳税所得额的30％可以从应纳税所得额中扣除。
以下政策专门针对汶川地震：
1.个人通过预扣单位向灾区捐款。代扣代缴单位应当出示政府机构或者非营利组织颁发的简易捐赠证书，代扣代缴单位记录的个人捐赠时间表等。代扣代缴税款时，应依法扣除。
2.如果个人通过政府机构或非营利组织直接向受灾地区捐款，并通过预扣税款纳税，则捐赠者应出示由政府机构或非营利组织签发的捐赠证书及时组织到扣缴单位。单位代扣代缴税款时，依法扣除；个人自行申报纳税的，税务机关根据收到的政府机构或者非营利组织的捐赠款，依法予以抵扣。
3.扣缴单位向税务机关全面申报个人所得税时，还应提交政府机构或非营利组织及其单位发出的接受捐赠的收据（副本）每个纳税人的捐款总额和当期扣除的捐款金额。
第四，各级税务机关本着鼓励纳税人捐赠的精神，加强对捐赠扣除的管理，并通过各种媒体广泛宣传捐赠扣除的政策，方法和程序，以提供高质量的捐赠。为方便纳税服务。扣缴单位和纳税人的具体操作。