如果不是该单位的雇员，则将根据劳动报酬扣除个人所得税。
公司专家评估费的核算方法：预提和缴纳的以现金支付的个人所得税计入相关的经营成本。
中有两种情况：
在第一种情况下，专家不是该部门的雇员，而专家评估费具有临时劳动报酬的性质，应在“雇员报酬应付劳动力成本”帐户中核算“并预扣个人所得税；
在第二种情况下，专家是单位的雇员，专家评估费的支付应视为雇员薪水的支付，这包括在“雇员应付工资”中”计算。
会计：
是使用某种会计方法将企业，机构或个人家庭中的所有经济交易记录在账簿上；指根据已核实无误的原始凭证和会计凭证，按照国家统一会计制度进行的会计处理。主题，两次进入簿记方法用于按时间顺序和分类方式在帐户簿中注册经济交易。注册账簿是会计工作的主要环节。
根据《中华人民共和国个人所得税法实施条例》第8条第4款：劳务报酬是指从事设计，装修，安装，制图，测试，检验，医疗，法律，会计，咨询，讲座，新闻，广播，翻译，审稿，书画，雕刻，影视，录音，录像，表演，演出，广告，展览，技术服务，介绍服务，经纪服务，代理服务及其他劳务服务。
因此，该单位支付的专家评估费应计算为劳务收入并缴纳个人所得税。
根据《中华人民共和国个人所得税法》：“劳动报酬，每次收入不超过4,000元，则费用减少800元； 4000元，将扣除20％。，余额为应纳税所得额。适用的比例税率为20％。 ”付款单位（您的公司）代扣代缴个人所得税。
如果劳动报酬的一次性收入过高，则可能要征收附加税。即：应纳税所得额超过2万至5万的，按照税法的规定计算应纳税额，再按应纳税额征收50％；超过50,000的部分，另加10％。
个人所得税评估费的20％直接由单位代扣。在学位（学位）教育期间，应按每月固定的400元扣除纳税人在中国继续教育（学位）的支出。
同一学位（学位）的继续教育的扣除期不能超过48个月。取得相关证书的当年，应扣减纳税人的技术人员职业资格继续教育和专业技术人员职业资格继续教育的支出，固定费用为3600元。
扩展数据
个人从事设计，装修，安装，制图，实验室，测试，医疗，法律，会计，咨询，演讲，新闻，广播，翻译，审阅，书画，雕刻，电影和电视，录音，录像，性能，性能，广告，展览，技术服务，介绍服务，经济服务，代理服务和其他劳工服务。
个人通过使用专利权，版权，商标权，非专利技术和其他特许权获得收入。通过提供版权使用权获得的收入不包括来自薪酬的收入。作者从公开拍卖（招标）其书面作品的正本或抄本所得的收入，应在特许权使用费项目中征税。