住房补贴属于个人所得税应税项目中的其他补贴收入，应计入当期工资和工资收入，计算并缴纳个人所得税
财税字[1997] 144号文规定，对参与改革的住房公积金，医疗保险基金和养老保险基金征收个人所得税，具体如下：
企业以现金方式支付给个人的住房补贴和医疗补贴，应全部计入接受者的当期工资，工资收入应缴纳个人所得税。但是，外国人以实际报销和报销的形式获得的住房补贴，仍将按照财政部和国家税务总局公告的规定暂时免征个人所得税。关于个人所得税政策的问题（财税字[1994] 020号）。
另外：根据《北京市地方税务局关于澄清与个人所得税有关的业务政策问题的通知》，京地水阁[2002] 597号：建设部，国家计委，财政部，人民银行和国务院机构事务管理局，建设银行，中国直接管理局和北京市人民政府《关于进一步深化北京市中央和国家机关住房制度改革的实施方案》的规定，住房补贴标准为个人从单位取得的个人暂免征税所得税，超过标准的部分计入月薪以计算税额。
财政部国家税务总局
关于征收住房公积金，医疗保险基金，养老保险基金的个人所得税的通知
发行日期：1997-11-07发行编号：财税字[1997] 144号
省，自治区，中央直辖市，有单独计划的市以及地方税务局：
根据国务院的统一部署，各地陆续发布了住房制度，医疗保险制度和养老保险制度改革实施方案。关于改革体系中的住房公积金，医疗保险基金和养老保险基金征收个人所得税的通知如下：
1.企业和个人提取住房公积金，医疗保险基金和基本养老保险基金，这些住房公积金，医疗保险基金和基本养老保险基金是按照国家或地方政府法规的比例实际提取并支付给指定金融机构的，个人当前的工资和工资收入。免征个人所得税。对于超过国家或地方政府规定缴纳的住房公积金，医疗保险基金和基本养老保险，应将超出部分计入个人的当期工资和工资收入，并计算个人所得税。（根据《财政部和国家税务总局关于基本养老保险金，基本医疗保险金，失业保险金和住房公积金有关个人所得税政策的通知》，财税[2006] 10，自2006年6月27日起废除。）
2.个人获得住房公积金，医疗保险和基本养老保险后，免征个人所得税。（根据国家财政总局财政部基本养老保险基本医疗保险保费失业...
2.个人获得住房公积金，医疗保险和基本养老保险后，免征个人所得税。（根据《财政部和国家税务总局关于基本养老保险金，基本医疗保险金，失业保险金和住房公积金有关个人所得税政策的通知》，财税[2006] 10，自2006年6月27日起废除。）
3.企业以现金形式支付给个人的住房补贴和医疗补贴，应全部计入接受者的当期工资和薪金，并按个人所得税征收。但是，按照《财政部，国家税务总局关于部分财政收入的通知》的规定，外国个人以实际报销和报销的方式获得的住房补贴仍暂时免征个人所得税。 《关于个人所得税的政策问题》（财税字〔1994〕20号）。
4.本通知自1998年1月1日起实施。原始的政策法规与本通知有抵触，应按照本通知执行。
从上述文件的精神可以看出，贵公司向员工发放的一次性住房补贴应按所支付金额确定的税率缴纳个人所得税。