股东的出资是否到位以及股权转让是两种不同的经济行为。股权转让与已付的出资无关。如果出资额不到位，公司成立时的原始出资股东应当承担连带责任。
为股权转让支付的个人所得税是根据股权转让收入与权益成本之间的差额缴纳的，因此应缴纳个人所得税。出资不足不影响个人所得税的缴纳。
对股权转让所得征收个人所得税的计税依据和适用税率：
《中华人民共和国个人所得税法》及其《实施条例》规定，个人股权转让的收入应以“财产转让收入”项目和资产和合理费用应从股权转让收益中扣除余额为应纳税所得额，并采用20％的税率计算和支付个人所得税。
在您给的情况下，股东A以其原始投资价值转让了他自己的股权，而他的转让收入为0。应税收入也为0，因此不需要个人所得税。换句话说，股权转让不需要征税，仅在发生溢价时才缴税。