如果不是该单位的雇员，则将根据劳动报酬扣除个人所得税。
根据《中华人民共和国个人所得税法实施条例》第8条第4款：劳务报酬是指从事设计，装修，安装，制图，测试，检验，医疗，法律，会计，咨询，讲座，新闻，广播，翻译，审稿，书画，雕刻，影视，录音，录像，表演，演出，广告，展览，技术服务，介绍服务，经纪服务，代理服务及其他劳务服务。
因此，该单位支付的专家评估费应计算为劳务收入并缴纳个人所得税。
根据《中华人民共和国个人所得税法》：“劳动报酬，每次收入不超过4,000元，则费用减少800元； 4000元，将扣除20％。，余额为应纳税所得额。适用的比例税率为20％。 ”付款单位（您的公司）代扣代缴个人所得税。
如果劳动报酬的一次性收入过高，则可能要征收附加税。即：应纳税所得额超过2万至5万的，按照税法的规定计算应纳税额，再按应纳税额征收50％；超过50,000的部分，另加10％。