个人所得税税款应该由取得所得的个人缴纳，不应该由公司负担。
如果你所说的收入12000元确实是补发工资应该分解到所属月份重新计算。
第一种方法，是将月薪3万与年终奖综合考虑。可以将部分工资以年终奖的形式体现，对工资和年终奖的发放金额进行调整后，反复测算这两种金额的比例，从而使个税整体下降。这是任何税务机关都挑不出毛病的办法，当然降税的幅度可能不会有你想象得那么多。
那么，有没有月工资3万合理避税的同时，还能大幅度提高到手工资的方法呢？
第二种方法，就是通过捷税宝以你自己的名义，去成立一个个人独资企业。现在大多数员工与公司之间都是紧密型的雇佣关系，员工通过和公司签订劳动合同的方式来获取报酬，报酬越高，工资个税也越高。而通过注册工作室（也就是成立个人独资企业）的形式和原本服务的公司签订服务合同来获取报酬，这样的话公司和员工之间就从雇佣关系变成了合作关系，原本的3万工资也变成了企业之间的业务往来款项。在不考虑社保的情况下，这种方式可以省很多个税。当然这种简单的省税方法也是有前提条件的，那就是你要选对工作室注册地，在有税收优惠的园区注册落地，才能更好地享受节税。
你要先想清楚，企业避税的税种，其实对于企业来说，无论是发放工资，还是以报销发票的名义，支出的金额都是一样的，发放工资，企业是不承担任何税金的，只有接受工资的个人，要承担个人所得税，所以企业所说的避税，不是给企业自己避税，而是给企业的员工规避个人所得税。
按个人所得税法规定，取得的工资收入要交个人所得税，在这个前提下，企业以报销发票的方式，将一部分工资费用的性质转变为报销费用，这样就在员工拿到同样的钱的情况下，减少了个人工资性质的收入，对于员工来说自然就起到了避税的作用。举例来说，如果一个人工资3000，按现行规定，起征点2000，要交税=（3000-2000）*10%%-25=75元，而如果这个人提供1000的发票，就变成费用报销1000，工资2000，税金则为零了，给个人省下了75元的个人所得税。
做这种操作，企业是有相当的风险的，肯为员工做这样的操作，说明企业很大程度上还是很维护员工权益的，虽然方式违法，但是对员工来说确实是好事。
因为是你们单位自己增加工资，所以税务局不知道是补发前面月份的工资，他们是以每个月的收入来计算所得税。希望单位以后早点补发。
——是按照一次性发放。个税按照实发金额计税，若单位要求在发工资或者奖金的日子里再结算给我是否符合法律规定？——不合法。但是如果当事人协商一致，也是可以的。 。可以要求单位把所欠工资奖金发给你。
？——你可以主张你的权力。比如你11个月没发工资我看法律规定离职当天或者第二天单位要将员工应得的工资奖金结算给员工。那么照这样说我是否能拿到我7月～9月份产生的奖金呢，不管你的所得是几个月的;3.结算的金额是否必须要在我离职当天或第二天给我？我们单位每月15日发工资，25日发奖金，但是个税却是把你一年的工作按照你一个月的收入计算纳税。 ，在第12个月一次性发放;2.如果可以拿到这部分奖金，个人所得税应该如何扣除？是按一次发放扣除？还是按总额除以3再扣除;
一般是税金计算错误的情况下，下月纠正后可以调整补发的，具体要查看工资单明细的
工资个税如何合理避税?
说到个人所得税，今年最大的热点就是起征点已经上调至五千元，尽管如此，对于很多人来说依然是一笔不小的支出。因此，很多企业采取各种手段帮助员工规避个人所得税，那么合理规避个人所得税的方法都有哪些呢?
下面就简单介绍几个常用到的避税方式：
1、提高职工的福利水平，使名义上的收入降低;
2、工资发放尽量在税前扣除额以下;
3、纳税人在尽可能长的时间内分期领取劳动报酬;
4、采取推迟或提前的方法，将各个月份的收入尽量拉平;
5、多缴“三险一金”;
6、部分计入工资单，其余工资采取用发票报销的方式发放。
这些都是企业常用到的工资个税如何合理避税的方式。可能有人会说，企业多发工资，少上报不就行了嘛，何必那么麻烦。在这里需要说明一下，非法逃税和合理避税是有很大区别的。千万不要有侥幸心理，随便有个想法就去付诸实施，这样的风险是企业承担不起的。