税务审计的风险在于，税务机关及其从事税务审计工作的人员应对他们制定的《税务处理决定》，《税务行政处罚决定》和《转让公安决定》承担法律责任。它不仅要求“决定”中引用的法律依据是正确的，操作程序是合法的，而且处罚是适当的，而且还要求对纳税人的违法行为进行彻底调查，以确保不会损失国家税。如果无法做到这一点，税务审计机关或税务审计人员应承担赔偿责任和是否承担转移的刑事责任。完全消除审计风险是不可能的，但我们可以采取一些预防措施，以降低风险程度并提高审计质量。
首先，我们应该从加强审计机构的内部建设开始。
建立和完善被审计单位的法律数据库和信息数据库。审计机构应适应经济形势的发展，建立专门的法律数据库，并经常对其进行更新，以确保可以为现场审计师提供全面，权威的法律支持。另外，可以将过去几年的审计情况汇总到一个动态数据库中，并且被审计单位可以根据基本情况，法规和政策，发现的问题以及审计的处理情况建立相应的数据数据库，并共享审核信息资源。这样，在提高审计工作效率的同时，还可以防止审计风险。
增强检查机构的计算机使用能力。首先是加强审计软件的应用和开发，以使其能够跟上被审计单位的计算机系统更新的进度而不会脱离。第二个是与被审计单位合作，并要求其应用软件在开发阶段保留审计接口。第三是针对不同系统设计针对性的检查和检查程序，以便检查人员可以对计算机系统进行常规检查，以最大程度地减少检查风险。四是加强审计机关的计算机硬件建设。
加强对审判程序的检查。一种是严格的三审制。即，案件受理人对检查程序的正确性和所附证据的完整性进行初步审查。首席审判官然后进一步检查案件的事实是否明确，证据是否具有决定性以及资格是否准确。当首席审判官完成审判并发出审判文件并将其提交给（股份）部门的负责人签名时，该部门（股份负责人）将对其进行审查，以确保案件得到妥善处理。第二是严格的集体审判制度。听证处（处）处长着眼于政策法规，负责人着眼质量，监察局审计组着眼处罚，较大（重）案件上报市局。案件审理。使税收处罚的程序和结果更加透明，并确保税收审计的质量。
完善审核案例分析系统。审计机关应当定期举行被检查单位的案件分析会议，形成制度。一是在执行过程中检查税收审计的选择，实施，审查和执行四个步骤，切实做到明晰事实，结论性证据，准确数字，文件规范，法律程序和适用法律法规。二是讨论税收政策的实施和自由裁量权的控制，以提高准确性。第三，经过长期的努力，逐步建立了一套完整的案例分析材料，总结了被调查对象所使用的逃税技巧和检查各类企业的基本方法，为将来审核工作的参考和比较案例处理示例。
其次，应通过加强检查过程的标准化来实施该检查。
加强调查前调查，合规性测试和其他工作。入户前，有必要加强调查前的调查，对被检查单位的经营和财务状况进行全面的调查和了解。这有助于检查员掌握审核的方向；它必须完全了解其内部控制，并且还必须考虑到被调查单位的实际情况，请考虑检查重点。关于被检查单位的内部控制程度，应进行符合性测试以确定内部控制是否有效，并为下一步评估审计风险提供必要的依据。
制定科学合理的检查计划。制定审计计划时，必须严格遵守审计规范的要求，将相关要素写入计划中，并详细列出审计风险的控制点，以指导审计工作的发展。此外，我们必须注意确定检查范围和扩大范围，以便使检查人员能够有针对性地开展工作。阐明重要性级别，
为检查员做出相关的专业判断提供参考。
审核文件编制的标准化。审核过程涉及很多文件，应按照标准化的要求准备，以避免随意性，尤其是取证材料和审核工作文件，但对于不同行业，也要注意统一的格式和准确的语言。审核过程的描述也应具有标准化和统一的标准。
检验方法的标准化。在审核过程中，应注意采用标准化方法。证据风险来自证据的选择及其证明力。如何防止遗漏重要证据并获得足够的证明力是控制证据风险的关键。审计证据必须具有相关的，重要的，能胜任的和足够的特征，要求仔细，审慎和合法地收集证据，并以科学的方式仔细分析和识别证据。此外，对于每个审核项目，我们必须从实际出发，选择适当的审核依据并做出科学判断，以便对审核中发现的问题进行准确的定性分析。定性依据应特别注意申请的范围，及时性和内容，以免造成不必要的审计风险。
此外，应努力提高团队的整体素质。
改变观念并提高对风险预防的认识。检查人员应从思想观念上深刻理解审计风险，并寻求积极有效的防范措施。
履行职责并明确检查员的职责。检查组成员应履行各自的职责，并且必须切实履行其对特定项目的职责。确认并奖励已完成尽职调查并完成项目的检查员；疏忽职守，违反法律法规，在审计工作中造成审计风险的，应当追究其责任。