1.公司法人税
（1）企业所得税
对于公司法人而言，新三板股份的转让属于财产转让的范围，公司所得税的税率为25％。
（2）营业税
中国现行税法规定，股票交易业务属于金融商品转让，属于金融保险业营业税项，税率为5％。
（3）印花税
在新三板发行的用于股票交易，继承和赠予证券交易所的股权转让收据应以公布时的实际交易金额为准，而转让方应支付证券（股票）交易的费用印花税，税率为1％。
2.个人投资者的税收
（1）个人所得税
目前，从上市公司的公开发行和转让的市场获得的转让上市公司的股份的个人免征个人所得税政策。
目前，业务收入暂时免于从事外汇，有价证券，非商品期货和其他金融产品交易的个人所赚取的收入。
写在新三届董事会上的股票转让收据，用于交易，继承和送交证券交易所，应以出版时的实际交易金额为准，而转让方应按1％的比例。计算税率是为了支付证券（股票）交易的印花税。符合公司法人的政策。
（4）股利红利
股息股息受制于不同的个人所得税政策。持有股份在1个月以内的个人，应按照全部股利计入应纳税所得额；持有股份1个月以上至1年以上的，从应纳税所得额中暂时扣除50％；如果超过1年，则应将临时减少额计入应纳税所得额的25％。这些收入统一缴纳20％的个人所得税税率。
根据《财政部国家税务总局关于特殊用途金融基金企业所得税处理有关问题的通知》（财税[2011] 70号）
根据《中华人民共和国企业所得税法》和《中华人民共和国企业所得税法实施条例》的有关规定（国务院令第512号，以下简称“简称《实施条例》，经国务院批准，特别关于使用财政资金处理企业所得税的通知如下：
1.企业从县级以上县人民政府财政部门和其他部门取得的财政资金，如果满足下列条件，应计入非应税收入：同时满足以下条件。收入金额从总收入中扣除：
（1）企业可以提供指定用途的资金支出凭证；
（2）分配资金的财务部门或其他政府部门对资金有特殊的资金管理方法或特定的管理要求；
（3）企业应分别核算资金和资金产生的支出。
2.根据《实施条例》第二十八条的规定，在计算应纳税所得额时，不得扣除上述非应税所得；计算应纳税所得额时不能扣除折旧和摊销。
3.企业在处理符合本通知第一条规定条件的金融资金的非应税收入后，五年内（60个月）内未发生任何支出，也未将其退还到财务部门或其他资金在获得资金的第六年，应将政府部门的部分计入应纳税所得额；计算应纳税所得额时，应扣除应纳税所得额总额中所包含的财政资金支出。
如果同时满足上述两个条件，则在计算应纳税所得额时从总收入中扣除。